Mauricio Bedoya Tabares

Línea de investigación: Química computacional aplicada al estudio de canales iónicos y al diseño racional de fármacos.

Formación Académica

• PhD en Ciencias Aplicadas (Universidad de Talca, Chile),
• Químico Farmacéutico (Universidad de Antioquia, Medellín, Colombia)

Descripción Línea de Investigación

Mi línea de investigación se enfoca en el modelado de sistemas biológicos como proteínas, membranas celulares y moléculas tipo fármaco a través de métodos computacionales de dinámica molecular clásica y métodos de muestreo aumentado y energía libre para describir los mecanismos subyacentes a procesos fisiológicos y así comprender la dinámica de unión entre diversas moléculas y sus blancos moleculares. Usando la información del modelado molecular se propone diseñar nuevas moléculas con posibles usos terapéuticos mediante el diseño racional de fármacos.

Colaboraciones principales:

Wendy González – Universidad de Talca

Leandro Martínez – Universidad de Campinas

Niels Decher – Philipps-University of Marburg

Aytuğ Kiper – Philipps-University of Marburg

Susanne Rinné – Philipps-University of Marburg

Publicaciones Relevantes

1. Giraldo SE, Bedoya M, Peña-Varas C, Santana PA, Bazzocchi IL, Jiménez IA, Marder M, Vergel NE, Guerrero MF, Ramírez D (2023) Iridoid esters from Valeriana pavonii Poepp. & Endl. as GABAA modulators: Structural insights in their binding mode and structure-activity relationship. J Pharm Pharmacogn Res 11(3): 367–380. https://doi.org/10.56499/jppres22.1570_11.3.367

2. Arévalo, B., Bedoya, M., Kiper, A. K., Vergara, F., Ramírez, D., Mazola, Y., Bustos, D., Zúñiga, R., Cikutovic, R., Cayo, A., Rinné, S., Ramirez-Apan, M. T., Sepúlveda, F. V., Cerda, O., López-Collazo, E., Decher, N., Zúñiga, L., Gutierrez, M., & González, W. (2022). Selective TASK-1 Inhibitor with a Defined Structure-Activity Relationship Reduces Cancer Cell Proliferation and Viability. Journal of Medicinal Chemistry, 65(22), 15014–15027. https://doi.org/10.1021/acs.jmedchem.1c00378

3. Kiper, A. K.; Bedoya, M.; Stalke, S.; Marzian, S.; Ramírez, D.; de la Cruz, A.; Peraza, D. A.; Vera-Zambrano, A.; Márquez Montesinos, J. C. E.; Arévalo Ramos, B. A.; Rinné, S.; Gonzalez, T.; Valenzuela, C.; Gonzalez, W.; Decher, N. Identification of a Critical Binding Site for Local Anaesthetics in the Side Pockets of Kv1 Channels. Br. J. Pharmacol. (2021), 178 (15), 3034–3048. https://doi.org/10.1111/bph.15480.

4. Decher, N.; Rinné, S.; Bedoya, M.; Gonzalez, W.; Kiper, A. K. Molecular Pharmacology of K2P Potassium Channels. Cell. Physiol. Biochem. (2021), 55 (S3), 87–107. https://doi.org/10.33594/000000339.

5. Bustos, D., Bedoya, M., Ramírez, D., Concha, G., Zúñiga, L., Decher, N., Hernández- Rodríguez, E. W., Sepúlveda, F. V., Martínez, L., & González, W. Elucidating the Structural Basis of the Intracellular pH Sensing Mechanism of TASK-2 K2P Channels. International Journal of Molecular Sciences (2020), Vol. 21, Page 532, 21(2), 532. https://doi.org/10.3390/IJMS21020532.

6. Rinné, S., Kiper, A. K., Vowinkel, K. S., Ramírez, D., Schewe, M., Bedoya, M., Aser, D., Gensler, I., Netter, M. F., Stansfeld, P. J., Baukrowitz, T., Gonzalez, W., & Decher, N. The molecular basis for an allosteric inhibition of K+-flux gating in K2P channels. ELife (2019), 8(8:e39476), 1–18. https://doi.org/10.7554/eLife.39476.

7. Bedoya, M., Rinné, S., Kiper, A. K., Decher, N., González, W., & Ramírez, D. TASK Channels Pharmacology: New Challenges in Drug Design. Journal of Medicinal Chemistry (2019), 62(22), 10044–10058. https://doi.org/10.1021/acs.jmedchem.9b00248.

8. Ramírez, D., Bedoya, M., Kiper, A. K., Rinné, S., Morales-Navarro, S., Hernández-Rodríguez, E. W., Sepúlveda, F. V., Decher, N., & González, W. Structure/Activity Analysis of TASK-3 Channel Antagonists Based on a 5,6,7,8 tetrahydropyrido[4,3-d]pyrimidine. International Journal of Molecular Sciences (2019), 20(9), 2252. https://doi.org/10.3390/ijms20092252.

9. Wiedmann, F., Kiper, A. K., Bedoya, M., Ratte, A., Rinné, S., Kraft, M., Waibel, M., Anad, P., Wenzel, W., González, W., Katus, H. A., Decher, N., & Schmidt, C. Identification of the A293 (AVE1231) Binding Site in the Cardiac Two-Pore-Domain Potassium Channel TASK-1: a Common Low Affinity Antiarrhythmic Drug Binding Site. Cellular Physiology and Biochemistry: International Journal of Experimental Cellular Physiology, Biochemistry, and Pharmacology (2019), 52(5), 1223–1235. https://doi.org/10.33594/000000083.

10. Rojas, J., Bedoya, M., & Ciro, Y. Current Trends in the Production of Cellulose Nanoparticles and Nanocomposites for Biomedical Applications. In M. Poletto & H. Ornaghi (Eds.), Cellulose-Fundamental Aspects and Current Trends (1st ed., pp. 193–228). InTech, (2015), https://doi.org/10.5772/61334.